Vào thứ Năm, Trump thông báo sẽ đề cử cựu ứng cử viên tổng thống độc lập Robert F. Kennedy Jr. làm Bộ trưởng Bộ Y tế và Dịch vụ Nhân sinh (HHS) trong chính phủ mới, động thái này đã gây ra chấn động lớn trong ngành y tế và dược phẩm. Nếu được Thượng viện phê chuẩn, Kennedy sẽ đứng đầu một trong những bộ phận lớn nhất của chính phủ Mỹ, chịu trách nhiệm quản lý hệ thống y tế công cộng bao gồm Medicare, bảo hiểm y tế Medicaid, Cục Quản lý Thực phẩm và Dược phẩm (FDA), Viện Y tế Quốc gia (NIH) và Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh (CDC), cùng các cơ quan quan trọng khác. Đề cử này bị các công ty dược phẩm coi là một "cơn ác mộng", vì những chủ trương của Kennedy có thể thách thức trực tiếp các chính sách và lợi ích hiện tại của ngành.
Từ năm 2005, Kennedy đã tích cực công bố thông tin phản đối vắc xin, tuyên bố rằng vắc xin có liên quan đến nhiều rủi ro sức khỏe, mặc dù nhiều nghiên cứu khoa học và chuyên gia y tế công cộng đã nhiều lần bác bỏ những tuyên bố này. Ông cũng cáo buộc chính phủ thiếu minh bạch thông tin trong lĩnh vực y tế công cộng và chỉ trích mối quan hệ lợi ích giữa các tổ chức y tế và các công ty dược phẩm. Dù quan điểm của ông bị giới y học nghi ngờ rộng rãi, nhưng thái độ cứng rắn của Kennedy về vấn đề sức khỏe không thay đổi, và ông cho biết sẽ thúc đẩy chính sách quản lý dược phẩm nghiêm ngặt hơn, khiến các công ty dược phẩm lo ngại về môi trường chính sách tương lai.
Sự ủng hộ của Trump đối với Kennedy không phải là nhất thời. Vào tháng 10 năm nay, Trump đã hứa với Kennedy, người đã hỗ trợ chiến dịch tranh cử của Trump, rằng nếu thành công vào Nhà Trắng, sẽ cho ông không gian để “phát triển đầy đủ” trong chính sách y tế. Việc đề cử lần này của Trump được coi là sự khởi đầu của việc thực hiện lời hứa đó, đánh dấu khả năng chuyển hướng mạnh mẽ trong chính sách y tế tương lai. Cả Trump và Kennedy đều chủ trương cắt giảm các cơ quan “tham nhũng” trong ngành công cộng, đặc biệt là một số cơ quan thuộc FDA, như phòng dinh dưỡng. Sau khi Trump trúng cử, Kennedy cho biết kế hoạch tổ chức lại các cơ quan này, thậm chí đề xuất loại bỏ một số cơ quan mà ông cho là “không cần thiết”.
Các nhà phân tích cho rằng, nếu cuối cùng Kennedy đảm nhận chức vụ Bộ trưởng Y tế, có thể sẽ gây tác động lớn đến chính sách y tế công cộng hiện tại, thúc đẩy tiêm chủng và quản lý ngành dược phẩm. Động thái này có thể dẫn đến tỷ lệ tiêm chủng giảm, quy trình thẩm định của FDA bị thắt chặt hơn và có thể gây ra những điều chỉnh chính sách quy mô lớn, đặc biệt là về giá thuốc, tiêu chuẩn phê duyệt và thay đổi quảng bá y tế công cộng. Các công ty dược phẩm sẽ theo dõi chặt chẽ tiến trình đề cử của Kennedy, và quá trình điều trần đề cử tại Thượng viện dự kiến sẽ thu hút sự chú ý rộng rãi và thảo luận gay gắt.